Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC22CQ9BRL7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC22CQ9BRL7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC22CQ9BRL7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC22CQ9BRL7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC22CQ9BRL7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms