Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPZ2

SPIN2B, Spindlin-2B, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2BQ9BPZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN2BQ9BPZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN2BQ9BPZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPIN2BQ9BPZ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN2BQ9BPZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPIN2BQ9BPZ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPIN2BQ9BPZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPIN2BQ9BPZ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIN2BQ9BPZ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIN2BQ9BPZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPIN2BQ9BPZ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms