Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
POP1Q99575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
POP1Q99575 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POP1Q99575 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
POP1Q99575 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POP1Q99575 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
POP1Q99575 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POP1Q99575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POP1Q99575 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POP1Q99575 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POP1Q99575 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POP1Q99575 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POP1Q99575 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POP1Q99575 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POP1Q99575 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POP1Q99575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
POP1Q99575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POP1Q99575 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
POP1Q99575 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POP1Q99575 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POP1Q99575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POP1Q99575 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POP1Q99575 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POP1Q99575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POP1Q99575 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POP1Q99575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
POP1Q99575 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POP1Q99575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POP1Q99575 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POP1Q99575 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POP1Q99575 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POP1Q99575 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POP1Q99575 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
POP1Q99575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POP1Q99575 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POP1Q99575 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
POP1Q99575 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
POP1Q99575 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
POP1Q99575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POP1Q99575 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
POP1Q99575 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
POP1Q99575 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
POP1Q99575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POP1Q99575 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POP1Q99575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
POP1Q99575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POP1Q99575 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
POP1Q99575 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POP1Q99575 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
POP1Q99575 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POP1Q99575 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
POP1Q99575 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POP1Q99575 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
POP1Q99575 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POP1Q99575 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POP1Q99575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POP1Q99575 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POP1Q99575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
POP1Q99575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
POP1Q99575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
POP1Q99575 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POP1Q99575 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POP1Q99575 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
POP1Q99575 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POP1Q99575 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POP1Q99575 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POP1Q99575 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POP1Q99575 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POP1Q99575 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
POP1Q99575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POP1Q99575 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
POP1Q99575 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POP1Q99575 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
POP1Q99575 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POP1Q99575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
POP1Q99575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
POP1Q99575 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
POP1Q99575 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POP1Q99575 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POP1Q99575 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POP1Q99575 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POP1Q99575 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POP1Q99575 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POP1Q99575 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POP1Q99575 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POP1Q99575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POP1Q99575 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POP1Q99575 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
POP1Q99575 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POP1Q99575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POP1Q99575 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms