Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCF12Q99081 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCF12Q99081 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCF12Q99081 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TCF12Q99081 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCF12Q99081 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms