Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNL2Q96S94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNL2Q96S94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNL2Q96S94 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNL2Q96S94 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNL2Q96S94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNL2Q96S94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms