Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX18Q96RF0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX18Q96RF0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX18Q96RF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX18Q96RF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX18Q96RF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX18Q96RF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms