Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOPNLQ96NB1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FOPNLQ96NB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FOPNLQ96NB1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FOPNLQ96NB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOPNLQ96NB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOPNLQ96NB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOPNLQ96NB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms