Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI6

PPM1M, Protein phosphatase 1M, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1MQ96MI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPM1MQ96MI6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPM1MQ96MI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPM1MQ96MI6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1MQ96MI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1MQ96MI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPM1MQ96MI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPM1MQ96MI6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms