Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC138Q96M89 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC138Q96M89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC138Q96M89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC138Q96M89 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC138Q96M89 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC138Q96M89 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms