Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX22Q96L94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX22Q96L94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX22Q96L94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX22Q96L94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX22Q96L94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms