Protein–RNA interactions for Protein: Q96L33

RHOV, Rho-related GTP-binding protein RhoV, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOVQ96L33 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHOVQ96L33 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOVQ96L33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHOVQ96L33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOVQ96L33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOVQ96L33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOVQ96L33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms