Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM8Q96KF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM8Q96KF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM8Q96KF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM8Q96KF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM8Q96KF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM8Q96KF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms