Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC45A3Q96JT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC45A3Q96JT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC45A3Q96JT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC45A3Q96JT2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC45A3Q96JT2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC45A3Q96JT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC45A3Q96JT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms