Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IFT43Q96FT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IFT43Q96FT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT43Q96FT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IFT43Q96FT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFT43Q96FT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IFT43Q96FT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms