Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STAMBPL1Q96FJ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STAMBPL1Q96FJ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STAMBPL1Q96FJ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAMBPL1Q96FJ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
STAMBPL1Q96FJ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STAMBPL1Q96FJ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms