Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MISP3Q96FF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MISP3Q96FF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MISP3Q96FF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MISP3Q96FF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MISP3Q96FF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MISP3Q96FF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms