Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM12Q96EX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM12Q96EX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM12Q96EX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM12Q96EX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM12Q96EX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms