Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF21AQ96BD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF21AQ96BD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF21AQ96BD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF21AQ96BD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHF21AQ96BD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHF21AQ96BD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHF21AQ96BD5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms