Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UTP4Q969X6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UTP4Q969X6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UTP4Q969X6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UTP4Q969X6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UTP4Q969X6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UTP4Q969X6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UTP4Q969X6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms