Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NINJ1Q92982 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NINJ1Q92982 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NINJ1Q92982 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NINJ1Q92982 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NINJ1Q92982 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms