Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GATA6Q92908 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GATA6Q92908 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GATA6Q92908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GATA6Q92908 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATA6Q92908 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATA6Q92908 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATA6Q92908 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GATA6Q92908 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATA6Q92908 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms