Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TAF4BQ92750 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF4BQ92750 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF4BQ92750 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF4BQ92750 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF4BQ92750 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF4BQ92750 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms