Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRUQ92729 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRUQ92729 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRUQ92729 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PTPRUQ92729 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTPRUQ92729 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRUQ92729 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRUQ92729 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRUQ92729 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRUQ92729 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms