Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF3Q92576 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHF3Q92576 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHF3Q92576 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHF3Q92576 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHF3Q92576 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHF3Q92576 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms