Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCSTNQ92542 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCSTNQ92542 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCSTNQ92542 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCSTNQ92542 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NCSTNQ92542 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCSTNQ92542 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCSTNQ92542 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms