Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF398Q8TD17 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF398Q8TD17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF398Q8TD17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF398Q8TD17 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF398Q8TD17 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF398Q8TD17 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF398Q8TD17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF398Q8TD17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms