Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNFQ8TB73 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDNFQ8TB73 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NDNFQ8TB73 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDNFQ8TB73 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDNFQ8TB73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDNFQ8TB73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDNFQ8TB73 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms