Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MCFD2Q8NI22 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCFD2Q8NI22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCFD2Q8NI22 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCFD2Q8NI22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCFD2Q8NI22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCFD2Q8NI22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCFD2Q8NI22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCFD2Q8NI22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCFD2Q8NI22 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms