Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG0

FAM71C, Protein FAM71C, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71CQ8NEG0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM71CQ8NEG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM71CQ8NEG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71CQ8NEG0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM71CQ8NEG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM71CQ8NEG0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM71CQ8NEG0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms