Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CNNM3Q8NE01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CNNM3Q8NE01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CNNM3Q8NE01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CNNM3Q8NE01 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CNNM3Q8NE01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CNNM3Q8NE01 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CNNM3Q8NE01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CNNM3Q8NE01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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