Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNRF1Q8ND25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNRF1Q8ND25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNRF1Q8ND25 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF1Q8ND25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNRF1Q8ND25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNRF1Q8ND25 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms