Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBZ0

INO80E, INO80 complex subunit E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80EQ8NBZ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INO80EQ8NBZ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
INO80EQ8NBZ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
INO80EQ8NBZ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
INO80EQ8NBZ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
INO80EQ8NBZ0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
INO80EQ8NBZ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms