Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCO5AQ8N6Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMCO5AQ8N6Q1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMCO5AQ8N6Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCO5AQ8N6Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCO5AQ8N6Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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