Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OTUD6BQ8N6M0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OTUD6BQ8N6M0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
OTUD6BQ8N6M0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OTUD6BQ8N6M0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OTUD6BQ8N6M0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OTUD6BQ8N6M0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OTUD6BQ8N6M0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OTUD6BQ8N6M0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms