Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDCL2Q8N4E4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDCL2Q8N4E4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PDCL2Q8N4E4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDCL2Q8N4E4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDCL2Q8N4E4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDCL2Q8N4E4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms