Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDUFAF2Q8N183 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NDUFAF2Q8N183 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NDUFAF2Q8N183 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDUFAF2Q8N183 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDUFAF2Q8N183 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDUFAF2Q8N183 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDUFAF2Q8N183 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NDUFAF2Q8N183 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms