Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TREML1Q86YW5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TREML1Q86YW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TREML1Q86YW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TREML1Q86YW5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TREML1Q86YW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TREML1Q86YW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TREML1Q86YW5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms