Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHSY1Q86X52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHSY1Q86X52 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHSY1Q86X52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHSY1Q86X52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHSY1Q86X52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHSY1Q86X52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHSY1Q86X52 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHSY1Q86X52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHSY1Q86X52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms