Protein–RNA interactions for Protein: Q86W33

TPRA1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1Q86W33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRA1Q86W33 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRA1Q86W33 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPRA1Q86W33 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPRA1Q86W33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TPRA1Q86W33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPRA1Q86W33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TPRA1Q86W33 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms