Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLNKQ7Z7G1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLNKQ7Z7G1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLNKQ7Z7G1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLNKQ7Z7G1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLNKQ7Z7G1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLNKQ7Z7G1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLNKQ7Z7G1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms