Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTOP3Q7RTS5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTOP3Q7RTS5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
OTOP3Q7RTS5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTOP3Q7RTS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTOP3Q7RTS5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
OTOP3Q7RTS5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTOP3Q7RTS5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms