Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TBC1D9Q6ZT07 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TBC1D9Q6ZT07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TBC1D9Q6ZT07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TBC1D9Q6ZT07 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TBC1D9Q6ZT07 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TBC1D9Q6ZT07 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TBC1D9Q6ZT07 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TBC1D9Q6ZT07 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TBC1D9Q6ZT07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TBC1D9Q6ZT07 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms