Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DPPA3Q6W0C5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DPPA3Q6W0C5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DPPA3Q6W0C5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DPPA3Q6W0C5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DPPA3Q6W0C5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DPPA3Q6W0C5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms