Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DPPA3Q6W0C5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DPPA3Q6W0C5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DPPA3Q6W0C5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DPPA3Q6W0C5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DPPA3Q6W0C5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DPPA3Q6W0C5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DPPA3Q6W0C5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DPPA3Q6W0C5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DPPA3Q6W0C5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DPPA3Q6W0C5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DPPA3Q6W0C5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DPPA3Q6W0C5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DPPA3Q6W0C5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DPPA3Q6W0C5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DPPA3Q6W0C5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPPA3Q6W0C5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DPPA3Q6W0C5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DPPA3Q6W0C5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DPPA3Q6W0C5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DPPA3Q6W0C5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DPPA3Q6W0C5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DPPA3Q6W0C5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DPPA3Q6W0C5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DPPA3Q6W0C5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DPPA3Q6W0C5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DPPA3Q6W0C5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DPPA3Q6W0C5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DPPA3Q6W0C5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPPA3Q6W0C5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DPPA3Q6W0C5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DPPA3Q6W0C5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DPPA3Q6W0C5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DPPA3Q6W0C5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPPA3Q6W0C5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPPA3Q6W0C5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DPPA3Q6W0C5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPPA3Q6W0C5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DPPA3Q6W0C5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DPPA3Q6W0C5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DPPA3Q6W0C5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DPPA3Q6W0C5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DPPA3Q6W0C5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DPPA3Q6W0C5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPPA3Q6W0C5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPPA3Q6W0C5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPPA3Q6W0C5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DPPA3Q6W0C5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DPPA3Q6W0C5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DPPA3Q6W0C5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DPPA3Q6W0C5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DPPA3Q6W0C5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DPPA3Q6W0C5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DPPA3Q6W0C5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DPPA3Q6W0C5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DPPA3Q6W0C5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DPPA3Q6W0C5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DPPA3Q6W0C5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DPPA3Q6W0C5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DPPA3Q6W0C5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DPPA3Q6W0C5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DPPA3Q6W0C5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DPPA3Q6W0C5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DPPA3Q6W0C5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DPPA3Q6W0C5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DPPA3Q6W0C5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DPPA3Q6W0C5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DPPA3Q6W0C5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DPPA3Q6W0C5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DPPA3Q6W0C5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DPPA3Q6W0C5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPPA3Q6W0C5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DPPA3Q6W0C5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DPPA3Q6W0C5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DPPA3Q6W0C5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DPPA3Q6W0C5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DPPA3Q6W0C5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DPPA3Q6W0C5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DPPA3Q6W0C5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms