Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NHLRC1Q6VVB1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLRC1Q6VVB1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLRC1Q6VVB1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NHLRC1Q6VVB1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms