Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBA3EQ6PEY2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBA3EQ6PEY2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3EQ6PEY2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA3EQ6PEY2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms