Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EMBQ6PCB8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EMBQ6PCB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EMBQ6PCB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EMBQ6PCB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EMBQ6PCB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EMBQ6PCB8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EMBQ6PCB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1208.9 ms