Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC30A6Q6NXT4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC30A6Q6NXT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC30A6Q6NXT4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC30A6Q6NXT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC30A6Q6NXT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC30A6Q6NXT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms