Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LPCAT4Q643R3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LPCAT4Q643R3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LPCAT4Q643R3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LPCAT4Q643R3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT4Q643R3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LPCAT4Q643R3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT4Q643R3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms