Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTE1Q5JU00 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTE1Q5JU00 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTE1Q5JU00 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCTE1Q5JU00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCTE1Q5JU00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCTE1Q5JU00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTE1Q5JU00 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCTE1Q5JU00 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTE1Q5JU00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCTE1Q5JU00 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms